هناك 7 نقاط اعتراض على الهيئة، تنتهك فيها هيئة الأمر بالمعروف مبادئ إسلامية رئيسية: 
1- 
أسس القرآن الخلافة ، وبالتالي الدولة الإسلامية ،  وبهذا تكون السلطة بيد السلطة الحاكمة ( الشرطة ) لا السلطة الدينية ( الهيئة ). 
2- 
الإجبار والإكراه في مسائل الدين تؤدي للنفاق، والله يكره النفاق ولا يقبل أعمالهم. 
3- 
طالما كانت الأعمال بالنيات، فالإجبار على عمل لا يفيد العامل ،  وقد جاء في الحديث الصحيح : " الدين النصيحة"  والنصيحة هنا بمعنى الإخلاص. 
4- 
إذا كان القرآن لم ينص على عقاب "دنيوي " للارتداد ،   فكيف يكون هناك عقاب دنيوي على ما هو أقل من الارتداد،  وبدون مستند من القرآن ؟ 
5- 
أكثر ما نهى عنه القرآن ،  لم يشرع له عقابا دنيويا،  فليس من حق الهيئة أن تقيم الحق والفضيلة. 
6- 
الدولة الإسلامية ،  دولة ليبرالية. ( لا تفرض عقيدة ولا منهاجا)،  وفرض الأفكار والأخلاق يؤدي  لدولة استبدادية  فاشية. 
7- 
الاسلام كفل حرية العقيدة ( وقل الحق من ربكم فمن شاء فليؤمن ومن شاء فليكفر.. ) ،  ثم أنه من غير المقبول فكريا ، أن الله وفر لغير المسلمين الحرية الفكرية والعقائدية ،  وحرمها على المسلمين ؟